在一项新的研究中，来自中国复旦大学、龙泉市疾病预防控制中心、武汉市疾病预防控制中心和温州市疾病预防控制中心等研究机构的研究人员探究了毛茸茸的小型病毒载体如何影响病毒的传播和进化。他们报告了669种病毒的鉴定结果，其中包括534种新型病毒，大大扩展了人们对哺乳动物病毒组（mammalian virome）---包括以前未知的冠状病毒和正腮腺炎病毒（orthorubulavirus）---的了解。相关研究结果发表在2023年10月12日的Cell期刊上，论文标题为“Host traits shape virome composition and virus transmission in wild small mammals”。

在这项新的研究中，这些作者利用宏转录组测序技术对来自中国四个栖息地的2443只野生蝙蝠、啮齿动物和鼩鼱的内脏器官和粪便样本进行了测序。几乎所有被研究的动物体内都发现了病毒。

这些作者发现了与已知人类或家养动物病原体---比如轮状病毒 A、汉城病毒（Seoul virus）、温州哺乳动物沙粒病毒（Wenzhou mammarenavirus）---相关的病毒，包括引起 SARS 和 COVID-19 等疾病的冠状病毒。此外，还有新发现的正腮腺炎病毒、猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪急性腹泻综合征冠状病毒（SADS-CoV）以及与 SARS 相关的冠状病毒。

这些作者提供了病毒跨物种传播的有力证据。例如，在多种野生小型哺乳动物体内发现了病毒，这表明这些病毒可以在不同动物物种之间传播，其中可能包括人类。

一种蝙蝠沙粒病毒的鉴定表明，沙粒病毒已使宿主从啮齿动物转移到蝙蝠。这一发现为这些病毒的进化提供了系统发育方面的启示。

在一些病毒科---星状病毒科（Astroviridae）、副粘病毒科（Paramyxoviridae）和小RNA病毒科（Picornaviridae）---中，这些作者发现了与已知序列相对不同的版本。

这些作者对蝙蝠、啮齿动物和鼩鼱的病毒丰富程度进行了比较。他们发现，鼩鼱携带的病毒总数最多，在单一物种中发现的病毒也最多，在史密斯鼩鼱（Smith's shrews）体内发现了来自 29 个病毒支系的多达 150 种病毒。其中一些鼩鼱病毒与之前在无脊椎动物中发现的病毒有关，而另一些则截然不同。

图片来自Cell, 2023, doi:10.1016/j.cell.2023.08.029。

这些作者在物种、属、科和目分类水平上观察到病毒的跨物种传播，在三种或更多哺乳动物物种中发现了相同的病毒。在宿主体内多器官分布的病毒更有可能在其他宿主物种中发现。这表明如果一种病毒存在于多种内脏器官中，它就有更大的机会传播到其他物种。

蝙蝠通常被认为比啮齿动物携带更多的病毒。在这项新研究采样的动物中，蝙蝠的病毒丰富度确实最高，其次是啮齿动物和鼩鼱。虽然蝙蝠体内发现的病毒总数多于啮齿类动物，但蝙蝠和啮齿动物每种物种发现的病毒平均数量却相差无几。