以SARS-CoV、HIV、HBV和AIV 等病原引起的新发传染病疾病模型开发、疫苗研制和疫苗评价为研究方向。 研制的灵长类AIDS和 SARS模型得到世界同行广泛认可。研究所成为中国主要的人类传染性疾病模型研制基地之一，也是多个AIDS相关的NIH研究项目参与实验室。同法国科学院联合开发的HIV治疗疫苗是近5年世界上治疗效果最好的疫苗之一。
SARS恒河猴模型是目前世界上目前最可靠的模型之一，相关工作有数篇发表在包括Nature medicine 在内的国际刊物上。研究成果荣获2004年北京市科学技术奖二等奖， 2006年度国家科技进步奖二等奖，2006年度AFLAS-ICLAS 青年科学家奖。
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